La encefalitis amebiana granulomatosa (EAG) es una enfermedad poco frecuente en el mundo, es causada por amebas de vida libre (AVL) y tiene un pronóstico malo, solo el 5% de los pacientes sobrevive, puesto que el diagnóstico y tratamiento suelen ser tardíos. En el caso se reporta a un adolescente con antecedentes epidemiológicos importantes quien sobrevivió a dicha enfermedad. En la tomografía computarizada (TC) de cerebro se halló una lesión inespecífica y se descartó una posible etiología neoplásica debido a la resonancia magnética nuclear (RMN) con espectroscopía que al demostrar un pico de lactato permitió clasificar la lesión cerebral de un origen inflamatorio e infeccioso. Finalmente, fue diagnosticado por un examen de líquido cefalorraquídeo (LCR) para AVL. Se enfatiza la relevancia del trabajo multidisciplinario, en que destaca lalabor del radiólogo para poder enfocar los estudios hacía una causa infecciosa.